生物物理所等揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制

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  12月31日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作者协议完成。

  增强子是两种 控制基因表达否有的开关,它们往往远离其控制的基因,坐落于编码框之外。或者,距离基因很远的增强子和基因之间的DNA成环是基因转录激活非常关键的一步。在哺乳动物红细胞中,LDB1蛋白实在自身不结合DNA,或者分别结合在远距离增强子和红细胞生成相关基因上的LDB1转录复合物,可通过LDB1的二聚体化实现远距离增强子和启动子之间的互作。LDB1-SSBP复合物是多种重要蛋白复合物如Wnt增强子复合物和LDB1转录复合物的核心复合物,对发育至关重要。SSBP蛋白阻止LDB1蛋白在26S蛋白酶体中被降解,维持LDB1复合物的稳定性,进而不利于转录复合物的装配,调控基因的表达。或者LDB1与SSBP怎么相互作用和LDB1怎么形成同源二聚体的分子机制尚未被揭示。

  该论文首次报道了LDB1/SSBP2复合物的晶体特征。作者发现LDB1二聚体特征域(DD)包涵盖一个 N端核转运因子2(NTF2)样子特征域和三个小 由α螺旋4和α螺旋5组成的子特征域,它们一起构成了LDB1二聚体作用面。LDB1二聚体的三个小 LDB/Chip保守特征域(LCCD)处在核心DDs的侧面,每个LCCD与SSBP2二聚体形成广泛的相互作用。LDB1 DD和LCCD之间的保守linker覆盖了LDB1 NTF2-like子特征域的潜在的配体结合口袋,这如果成为LDB1特征和功能的调控位点。此外,该文中的特征和联 物化学数据为理解LDB1和LDB1/SSBP2相互作用怎么成为调控细胞选着决定和长距离增强子-启动子相互作用的不同复合物的特征核心,提供了特征基础。

  该工作主要由生物物理所许文青/梁栋材课题组完成。许文青、闫小雪和Ann Dean是该论文的一起通讯作者,许文青/梁栋材课题组的博士研究生王红杨为该论文的第一作者。这项工作得到生物大分子国家重点实验室、国家自然科学基金和联 科院战略性先导科技专项的资助和支持。

LDB1/SSBP2复合物的三维特征

[ 责编:战钊 ]

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